Adobe Shockwave Player 11.5.9.615 - это например. Последняя версия. Что могут означать цифры?

11 - понятное дело, номер версии. Но за каким [пип] нужны 5, 9, 615? Логически рассуждая, должны быть версии и 3, 4, 6, 10, а также 001, 002, 003,… 613, 614 и тому подобное Они там что, каждую секунду новый релиз выпускают?

Это сборки. Прочитай книжку по программированию. Про то как грамотно именуют версии билдов.